中华日本哲学会成立于1981年4月1日，原名为中华全国日本哲学学会，1991年10月获中国民政部批准重新登记时改名为中华日本哲学会，2001年3月中国民政部再次登记批准(登记号4575)。
中华日本哲学会是全国性研究日本哲学、思想与文化的群众性学术团体，由全国各地大专院校、科研机构及其它政府机关、企事业单位、社会团体中的专业或业余爱好研究日本哲学、思想与文化的人员自愿组成。不以营利为目的。学会接受中国教育部的业务指导和民政部的监督管理。挂靠单位是延边大学。会址设在吉林省延边朝鲜族自治州延吉市延边大学内。
中华日本哲学会由延边大学已故的知名教授朱红星先生、中国社会科学院刘及辰先生、东北师范大学华国学先生等发起创立，朱红星先生为第一任理事长。1992年朱红星先生病逝，选举产生中国社会科学院丘成先生为理事长、延边大学李宗耀教授为副理事长、长春地方志李君超先生为秘书长的第二届理事会，法人代表为延边大学的李宗耀教授。2002年5月延边大学潘畅和教授任第三届理事长兼法人代表、武汉大学的徐水生教授、山东大学的牛建科副教授任副理事长;吉林大学朴今波副教授任秘书长。2005年8月学会根据发展的需要，选举中国社会科学院哲学所教授、博士生导师卞崇道先生为第四届会长、延边大学的潘畅和教授为副会长兼秘书长、武汉大学的徐水生教授、山东大学的牛建科副教授、中国社会科学院哲学所的王青副研究员任副理事长、法人代表仍为潘畅和教授。2011年9月北京外国语大学北京日本学研究中心郭连友教授被选举为第五届会长，延边大学的方浩范教授为副会长兼秘书长，法人代表为方浩范教授。
中华日本哲学会成立30多年来，积极开展日本哲学、哲学史的研究，多次在北京、延吉、杭州等地召开学术会，交流学术成果，加强中国、日本两国哲学思想的交流和哲学家的交往活动，为日本哲学与文化的研究做出了重要贡献。
学会每年编辑出版2期《中华日本哲学会通讯》，目前已出版44期。
办事机构所在地：吉林省延吉市公园路977号延边大学政治与公共管理学院
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